Na época de sua fundação no ano de 1995, o Labime tinha salas com infraestrutura de terminais de mainframe voltadas sobretudo para dar suporte ao ensino de graduação, tendo passado por inúmeras transformações ao longo dos últimos 30 anos. 

Há quase quinze anos foi dado início a um novo ciclo de reestruturação. Esta nova etapa ciclo se iniciou com a reestruturação da equipe de suporte do Labime concomitante ao redimensionamento dos serviços e procedimentos adotados no Labime. Alguns anos mais tarde o Labime foi destinado a estruturação de laboratórios temáticos para os diversos grupos de pesquisa do IME. Desde então, aos Laboratórios mais antigos como o Prestap (Programa de Estatística Aplicada) e o Latesi (Laboratório de Avaliação, Tecnologia Social e Inovação) foram se juntando novos laboratórios como o LabCad (Laboratório de Computação de Alto Desempenho), o LPG (Laboratório de Processamento Gráfico), LabCad (Laboratório de Computação de Alto Desempenho), LEIA (Laboratório de Estatística e Inteligência Artificial) e o Matilda (Laboratório de Métodos Computacionais e IA para Transparência e Dados Abertos). 

Considerando esta perspectiva de crescimento do complexo de laboratórios, o Labime, contando com múltiplos recursos de verbas de projetos de pesquisa e emenda parlamentar, passou por uma completa reestruturação elétrica. A partir de agora, vem sendo iniciada a busca por recursos para dotar o Labime de um cluster multiusuário compartilhado entre os diversos grupos de pesquisa do IME e seus parceiros.